Στο νησάκι υπάρχουν διάσπαρτες πολλές εκκλησίες, στις οποίες πραγματοποιούνται ενδιαφέροντα πανηγύρια. Οι Αγαθονησιώτες τηρούν ευλαβικά τις παραδόσεις τους, παρ’ όλο που τα ήθη και τα έθιμα τους πολλές φορές μοιάζουν με αντίστοιχα γειτονικών νησιών, απ’ τα οποία κατάγονται οι σημερινοί κάτοικοι.

Εκδηλώσεις στο Αγαθονήσι

Να πάτε στα πανηγύρια: Του Αγίου Παντελεήμονα (27 Ιουλίου). Πρόκειται για το μεγαλύτερο πανηγύρι του νησιού μαζί με αυτό του Δεκαπενταύγουστου. Προσφέρονται στους πιστούς, κρέας, ψωμί και γλυκά.

Τα Εννιάμερα της Παναγίας, στις 23 Αυγούστου, στην ομώνυμη εκκλησία στο Μεγάλο Χωριό, με παραδοσιακούς χορούς και τραγούδια.

Του Αη-Γιάννη του θερμαστή (αποκεφάλιση του Προδρόμου) στις 29 Αυγούστου. Αυτή τη μέρα όλοι έτρωγαν σταφύλια, φραγκόσυκα και αχινούς, γιατί αν κατανάλωναν οτιδήποτε άλλο θα πάθαιναν «θέρμη», εξ ου και το προσωνύμιο «θερμαστής» του Αγίου.